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Laboratório

Bioinformática e Biologia de Sistemas Computacional Departamento: Análises Clinicas

Coordenador(es): - Helder Takashi Imoto Nakaya
Endereço: INOVA USP - Centro de Inovação da USP - Av. Prof. Lúcio Martins Rodrigues, 370, bloco C, 4o andar - CEP CEP 05508-210 Butantã, São Paulo
Website: http://csbiology.com
Telefone: +55-11-2648-1130

Apresentação

O objetivo do laboratório consiste em resolver problemas biológicos através do desenvolvimento e utilização de ferramentas computacionais e análise de dados de técnicas de larga-escala. Nossa pesquisa é guiada tanto por hipóteses levantadas pelo modo científico tradicional, quanto por hipóteses levantadas pelos próprios dados (data-driven research). Ambos os casos envolvem a biologia de sistema, ou seja, a análise do comportamento e interação entre os componentes de um sistema biológico, visto como um todo e frente a diferentes perturbações.
 
Os projetos científicos são multi-discplinares e contam com a participação de excelentes colaboradores externos que são vitais para a geração de hipóteses, dados, análises alternativas e/ou para validações experimentais de nossos achados.
 
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Our laboratory focuses on investigating the basis of infectious disease and vaccination using computational systems biology. Pathogens and vaccines stimulate the immune system through an intricate and elaborate network of specialized cells and organs. Immune activation triggers several biological activities that require spatial and dynamic coordination. These activities range from recognition of pathogen-derived factors to cell intercommunication to cell differentiation. Systems biology approaches provide a comprehensive way of dissecting the complex interactions within these processes, and can lead to a better understanding of vaccine-induced immunity and disease pathogenesis. In recent years, systems biology has been successfully applied in analyzing the immune response to a wide range of vaccines and infectious agents. However, dealing with the large amount of data generated from high-throughput techniques and the inherent complexity of the immune system represent major computational and biological challenges. Our goal is to develop and apply systems biology tools to unraveling novel insights into the molecular mechanisms of immunity.